为支持各学科科研人员在港澳台研究领域开展自由探索和自主创新研究，培育港澳台研究中青年学术骨干，建设高层次的区域和国别研究基地，在教育部区域国别研究经费以及学校“985工程”三期经费的支持下，中山大学港澳台研究中心分别进行了“2012年度中山大学港澳研究项目”以及“2012年度中山大学台湾研究项目”的招标工作，共有23个项目获得资助：
| 序号 |
承担人 |
项目名称 |
| 港澳研究部分（按姓氏拼音排序） |
| 1 |
陈广汉 |
香港政府“积极不干预”政策的反思 |
| 2 |
陈丽君 |
2017年行政长官普选预测及其应对研究 |
| 3 |
关红玲 |
香港创意产业发展与国际比较 |
| 4 |
黎熙元 |
内地人的港生孩子对香港的影响 |
| 5 |
李小瑛 |
香港劳动市场与最低工资研究 |
| 6 |
刘祖云 |
澳门中间阶层现状与趋势研究 |
| 7 |
毛艳华 |
香港新兴产业的培育与发展研究 |
| 8 |
袁持平 |
澳门与横琴合作中的产业选择研究 |
| 9 |
赵大英 |
香港国际航运中心升级研究 |
| 10 |
张光南 |
推动广东企业通过香港“走出去”研究 |
| 11 |
周运源 |
澳门与南沙新区经济合作发展研究 |
| 台湾研究部分（按姓氏拼音排序） |
| 1 |
代中现 |
两岸在钓鱼岛问题和南海问题上合作的途径和方式探讨 |
| 2 |
顾静 |
美国重返亚洲背景下两岸在东亚地区制度建设中的合作途径探讨：以TPP为例 |
| 3 |
黄新飞 |
ECFA框架下经济一体化对海峡两岸生产率和经济增长潜力的影响机制研究 |
| 4 |
黄云静 |
两岸佛教交流与“一个中国”认同 |
| 5 |
林江 |
台商在大陆投资研究 |
| 6 |
刘燕 |
台湾民众国家认同问题研究——基于文化认同的研究视角 |
| 7 |
邱捷 |
广东历史文化资源与对台工作 |
| 8 |
史卫 |
积极引导台商在粤投资
加快推动广东转型升级 |
| 9 |
张光南 |
ECFA框架下两岸经济贸易影响研究 |
| 10 |
张亮 |
ECFA及其实施中的法律问题研究 |
| 11 |
周运源 |
台湾与港澳地区经济贸易关系研究 |
| 12 |
朱卫斌 |
从缓和到建交：美国对华关系中的台湾问题 |
