港澳珠三角资料室成立于2000年9月，现设于中山大学文科楼6楼，占地面积约200平方米。资料室采用了适合小型图书馆的图书馆自动化系统，现设有中英文图书书库1个、统计资料阅览室、现刊阅览室及过刊阅览室各1个。作为港澳台文献资源较为丰富的特藏馆之一，本资料室有馆藏文献近2万册，中英文过刊5000多册，中英文现刊102种。资料室还收藏了各类统计资料100多种，范围包括港澳地区、广东省的21个地级市及部分县市（区）、以及长三角地区、泛珠三角其它地区。馆藏文献还包括港澳特区政府统计处提供的各类主题报告及统计资料，珠三角地区各市（区）政府调研报告和其它内部资料。
       港澳珠三角资料室主要为本中心（院）的师生员工及专（兼）职科研人员、博士后提供文献查询及借阅服务，同时也欢迎从事粤港澳研究的校内其它院系的师生前来查阅资料。